«Время и судьбы» - наша главная экспозиция рассказывает о Шуе и шуянах к. XIX – н. XX века: показывает этапы застройки города, развитие образования, духовной культуры, развитие купечества и торговли, промышленности. Показан Шуйский уезд в революционных событиях начала ХХ века, история Гражданской войны, участие в ней шуян под руководством М.В. Фрунзе, жизнь города во время войны. Представлены фотографии и документы о последних годах жизни и деятельности М.В. Фрунзе.

«Макет города, город макетов» - выставочные залы расположены в купеческих подвалах: экспонируется макет Шуйского кремля, макет исторической части города Шуи к.XIX – н.XX века, а также макеты храмовых комплексов Шуи и окрестностей.

«Сосуды с секретами» - уникальная, единственная в мире коллекция сосудов с секретами поступила в фонды музея в дар А.Т. Калинина. В коллекцию входят 270 сосудов для жидкостей XIX – ХХ вв., использование которых связано с раскрытием некой тайны, разгадкой секрета или выполнением необычных действий.